通常在線水質分析儀所需的主要維護便是對取樣管路、取樣艙進行清潔。

    一般對這幾處部件進行清洗的簡單辦法是采用增大閥門開度、提高樣水流速的方法，或者打開在取樣管路中加裝的反沖洗管路的閥門也能對其進行清洗。

    但對原水，模擬斜管、沉淀水儀表的取樣艙進行清洗時，僅依靠這類方法是無法完成清潔的，更多的是需要對取樣艙、探頭進行直接清洗。

    另外，在對某些型號的余氯儀進行維護時，因其取樣艙里裝有保持電極表面不被氧化的石英砂，所以還要注意取樣艙中存余石英砂的數量。

    此外，在整個清潔過程中，應注意操作規范，避免因情節操作不規范導致儀器出現損壞。

    在對在線水質分析儀進行清洗時還應對清洗周期進行把握.根據不同情況下，多功能水質分析儀的實際情況進行定期清理，以避免因清潔不及時導致多功能水質分析儀的使用出現誤差。